淡水湖：玛旁雍错、塔若错、普莫雍错、羊卓雍错。青藏高原湖区共有大小湖泊1500多个，其中，面积1平方公里以上的湖泊1091个，面积44993.3平方公里，大于10平方公里湖泊有346个，总面积为42816.10平方公里。

约占全国湖泊总面积的49.5%。该区湖泊以咸水湖和盐湖为主，较著名的湖泊有纳木措、青海湖、察尔汗盐湖、鄂陵湖等。