明代的国家权力结构和运行机制是一个复杂而多层次的系统。在最高层，皇帝拥有绝对的权威，并通过内阁和各部来管理国家。内阁由最有声望和经验的大臣组成，负责为皇帝提供建议，并执行他的命令。各部负责管理不同的事务，如军事、财政、外交等。

在中央政府之下，地方政府也按照类似的模式组织。每个省都有一个巡抚，他是该地区的最高行政长官，负责执行中央政府的法律和政策。巡抚还要与地方士绅合作，以维持社会秩序和稳定。

此外，明代还设立了监察机构，如都察院和六科给事中，负责监督政府官员的行为，确保他们遵守法律和道德规范。这些机构也负责接受民众的投诉和申诉，并调查和处理违法行为。

总体而言，明代的国家权力结构和运行机制是一个相当复杂的系统，旨在平衡中央集权和地方自治，以及维护社会秩序和稳定。