要在中药店刷医保，首先需要确保中药店与医保系统有合作关系。在购买药品时，将医保卡交给药店工作人员，他们会使用POS机刷卡。

POS机会读取医保卡上的信息，并与医保系统进行实时交互，确认卡内余额和药品是否符合医保政策。如果符合条件，医保系统会扣除相应费用，而不符合条件的部分需要自费支付。

刷卡成功后，药店会提供购药凭证，可用于报销或结算。请注意，不同地区的医保政策和操作流程可能有所不同，具体操作请咨询当地医保部门或药店工作人员。