阿图什是新疆的一个城市，如果需要在阿图什办理边境通行证，可以前往当地的出入境管理机构进行申请，通常为市公安局出入境管理处。您可以在当地公安局的官网上查询具体地址和联系方式，也可以前往当地所在区、县的公安局进行咨询。申请边境通行证需要提供相关证件、照片等材料，具体要求可以咨询当地出入境管理机构。