在盖好章的合同电子版上签字，有以下几种方式可以选择：

1. 电子签名软件：利用电子签名软件，在合同电子版上直接进行电子签名，然后保存文件。

2. 扫描签名：将盖好章的合同电子版打印出来，手写签字后再扫描成电子版文件。

3. 数字签名：使用数字证书或数字签名工具，在合同电子版上进行数字签名。

无论采用哪种方式，签字后都应该保存文件并确保合同的完整性和真实性，以便在法律和商业上具有法律效力。