牙、志乃和雏田三人的秘密主要是指他们各自的一些糗事或私人情感。

志乃的秘密是他自己吃了药后笑到癫痫的事情，这展示了他在日常生活中不为人知的一面。雏田的秘密是她喜欢鸣人，这个秘密虽然对一部分人来说可能不是完全公开的，但它在整个故事中是一个重要的情感线索。而牙的秘密是他因为不服气但又崇拜鸣人而傻乎乎地效仿鸣人，这体现了他对鸣人的敬佩和自身的一些性格特点。

这些秘密在故事中可能是为了增强角色之间的亲密感和互动，同时也展示了他们作为普通人的真实和脆弱一面。