工程开票后的做账方法如下：

开工程增值税发票 。借记银行存款或应收账款，表示收到客户支付的款项，入账时记录在银行存款账户或应收账款账户中；贷记主营业务收入，表示销售商品或提供服务所获得的款项收入，相关的发票金额应在主营业务收入账户中计入；应交税费-应交增值税（销项税额），这是企业收到工程款所要支付的税费，应该计入应交增值税账户中。

收到工程款 。借记银行存款，表示收到客户支付的工程款项；贷记预收账款-工程，因为在开展工程业务时，客户有可能会在工程开始之前支付部分工程款项作为预付款。

工程完成时或可按百分比确认收入 。借记预收账款，企业在接受客户的工程预付款时，需要记录这部分款项是预收款。