佛鳄龟的饲养盒颜色应该选择暗色系，比如深绿色或棕色。这是因为佛鳄龟喜欢在阴暗的环境下活动，浅色的饲养盒会使它们感到不舒适。此外，暗色系的饲养盒还可避免反射出过强的光线，对佛鳄龟的眼睛造成刺激。