员工职务侵占是指员工利用其职权或职务之便，侵吞、盗窃、挪用公司或者单位的财物等行为，属于职务犯罪的一种，需要及时立案进行处理。 具体的立案流程如下：
事先准备材料：当发现员工职务侵占行为后，要及时收集相关证据，如涉案财物的相关记录、人员出入记录等。
报案：将收集到的证据材料提交给公安机关，向当地派出所或公安局报案。
立案：公安机关会根据收集到的证据材料和相关调查取证情况来决定是否立案，并给出处理意见。
审查起诉：如果涉案金额较大或者情节严重，公安机关可以将案件移交检察机关审查起诉。
审判：经过检察机关审查起诉后，如果案件被批准立案，那么就会进入审判程序，等待法院的判决。