根据地方政策规定，新晃县龙溪古镇旧房改造可修两层。

原因是为了保护传统文化和古建筑，新晃县政府对龙溪古镇旧房改造进行了相关规定，规定了修改高度和外立面等内容。

据了解，两层高度改造旧房可以满足生活需要，避免过度改造破坏古建筑历史文化价值。

同时，也方便居民的生活和出行，符合当地实际情况。

所以，新晃县龙溪古镇旧房改造只可修两层，但这仍能满足居民需求和地方政策要求。