如果在住院期间忘记使用新农合，可以在出院后尽快到当地医保经办机构办理报销手续。需要携带相关医疗文件和住院发票，以及新农合卡进行申报。如果因为时间原因等特殊情况未能及时申报，可以进行补报或延迟申报，但需要遵守相关报销规定和时间限制。建议在使用医疗服务前了解相关报销政策和流程，避免出现忘记使用新农合的情况。