苏州员工辞职后，公司需要按照相关法律法规的规定处理员工的社保。

首先，公司应及时办理员工的离职手续，包括注销员工的社保账户。

其次，公司需要向社保部门报告员工的离职情况，并停止为其缴纳社保费用。

最后，公司应向员工支付其在职期间的社保费用的余额，包括个人和公司共同缴纳的部分。

公司应确保按照法律规定，妥善处理员工的社保问题，保障员工的权益。