区别如下：

1. 还款方式：逾期主动还款是用户在还款期限内主动选择使用支付宝账户余额或绑定的银行卡进行手动还款；自动扣款是用户授权支付宝从绑定的银行卡中自动扣款。

2. 付款时间：逾期主动还款需要用户在指定期限内手动完成还款，而自动扣款则是在还款日当天（或约定日期）系统自动从银行卡中扣除应还款项。

3. 还款结果：逾期主动还款用户可以实时查看还款状态，确认是否还清所有欠款；自动扣款用户需要保证绑定的银行卡有足够的余额，否则可能会因为扣款失败而产生罚息和滞纳金等费用。

总之，逾期主动还款和自动扣款都是还款的方式，但前者需要用户手动操作，后者则是系统自动扣款。无论采用哪种方式，都要确保按照合同约定及时还款，以避免产生不必要的费用和影响信用记录。