宜良九乡溶洞是由地下岩石溶解而形成的。该区域地质构造活跃，地下水不断侵蚀石灰岩，溶解出石灰岩中的钙质和碳酸盐等物质，逐渐形成了洞穴。

长期以来，地质活动、气候变化等因素也对溶洞的形成产生了重要影响。该地区的地形地貌复杂，形成了各种大小不同的洞穴系统，而宜良九乡溶洞作为其中的一个代表，成为了一个自然景观和旅游胜地。