茂名高州农村建房超出面积的处理方式如下：首先，对于超出部分，需要在土地登记簿和土地权利证书记事栏内注明超过标准的面积数。其次，在分户建房、房屋拆迁翻建或政府实施村庄集镇规划重新建设时，村民需让出超占的面积后，重新进行确权登记。此外，超出面积还可能被视作非法占用土地，由县级以上人民政府土地行政主管部门责令退还，并可能面临罚款或其他处罚。

以上内容仅供参考，具体处理方式可能会因实际情况而有所不同，建议咨询当地土地管理部门或律师以获取更详细的信息。