灭绝战神的结局是，神灵原木神境陷入了无定形态，被封印在九龙环之中，宅猪被封印在永恒之塔，剑神缔造者被集体封印到神界，灭天斧被奥马诺用来封印毁灭之门，而灭绝战神则被封印在落日神殿。