方巾扎染的捆扎方式有折叠捆扎法和卷曲捆扎法两种。

折叠捆扎法是将方巾对折成四倍，然后在对折处捏住，沿着不对折的部位将方巾折叠成不规则的形状，最后根据需要进行染色。

卷曲捆扎法是将方巾放在平面上，然后将宽度大约为1cm的部位进行沿着长轴卷曲，直到卷曲成一根笔螺形状，用橡皮带或者线松紧捆扎好，最后进行染色。

不同的捆扎方式会形成不同的花纹效果，可以根据需要进行选择。