独孤九剑没有明确的结局。小说中描述了独孤求败使用九剑后消失的情节，但他是否死亡或没有生命迹象却不得而知。

另外，后来随着其他人学习九剑，独孤九剑在武林中继续传承下去，这也为独孤九剑的结局留下了悬念。无论如何，独孤九剑已经成为武侠小说中的经典之作，至今仍被广泛传阅和研究。