武大测绘学硕和专硕的主要区别在于学习内容和培养目标。测绘学硕士更加注重理论研究和科学研究能力的培养，培养学生成为能够从事科学研究和教学工作的高级专门人才；而测绘学专业硕士则更注重技术和实践能力的培养，培养学生成为能够从事测绘技术应用、管理和研发的专门人才。此外，两者入学条件和毕业要求也有所不同。