在一般情况下，如果涉及的是民事纠纷，如债务纠纷，那么在立案后，如果双方能够通过协商达成还款协议，那么就不会追究刑事责任。然而，这并不意味着所有的协商还款都能避免刑事责任。

在一些情况下，如果债务人故意逃避债务，例如通过欺诈手段获取贷款或信用卡透支，然后在立案后试图通过协商还款来逃避法律责任，那么这可能构成犯罪行为，如诈骗罪。在这种情况下，即使双方达成了还款协议，债务人仍然可能面临刑事责任的追究。

另外，如果协商还款后，债务人仍然不履行还款协议，债权人可以向法院申请强制执行。如果债务人在执行过程中仍然故意逃避债务，例如隐藏财产或转移资产，那么这也可能构成拒不执行判决、裁定罪，面临刑事责任的追究。

因此，虽然协商还款通常可以避免刑事责任，但具体情况还需要根据案件的具体情况来判断。在任何情况下，如果涉及法律纠纷，最好咨询专业律师的意见，以确保自己的权益得到保护。