温州医科大学的前身是温州医学院。

因为1981年，温州市卫生局决定设立温州医学院，以提高本地区的医疗卫生水平和培养人才为目的。

2003年，温州市政府批准将温州医学院升格为本科大学，即现在的温州医科大学。

进一步地，温州医科大学是一所综合性医科大学，设有医、理、工、管、文、药、护七个学科门类，其中医学为一级学科。