不在一个区。

1、中国科学技术馆，位于北京市朝阳区北辰东路5号，在北京的北部，东临亚运居住区，西濒奥运水系，南依奥运主体育场，北望森林公园。

2、北京自然博物馆位于北京市东城区天桥南大街126号，在北京的南部。

3、中国科技馆和自然博物馆一南一北，相隔整个城区，距离在18公里左右。