深圳申请停领失业保险金不通过通常是因为申请人提交的资料不全或不符合要求，例如没有提供有效的解除劳动合同证明、没有提供与失业原因相关的证明材料等。

此外，申请人也可能存在违规行为，如在领取失业保险金期间未按规定时间到岗、拒绝就业机会等，这些都会导致停领失业保险金。