新农合断交了，在手机上补交的步骤如下：

打开支付宝，点击“市民中心”。

选择“社保”，点击“社保缴费”。

输入身份证号码，点击查询，选择“城乡居民医疗保险”。

输入缴费年份，点击查询，确认信息无误后提交即可。

请注意，不同地区的操作步骤可能略有差异，建议咨询当地相关部门以获取最准确的补交方式。