南开大学的硕士在上海不能直接落户。

上海落户需要满足一定的条件，包括但不限于有稳定的工作、缴纳社会保险等。此外，不同高校的硕士在上海落户的政策可能也有所不同。

因此，如果想要在上海落户，需要了解相关政策并满足相应的条件。