医院清退编外用人一般需要遵循以下程序：

1. 了解相关政策：医院清退编外用人需要遵循相关的政策法规，了解相关政策非常重要。可以查阅国家和地方有关编外用人政策法规，明确清退程序和条件。

2. 制定清退方案：医院需要制定清退方案，明确清退对象、清退时间、清退条件、清退程序等详细内容，以规范清退工作。

3. 通知被清退人员：医院需要向被清退的编外用人发出通知，并告知其清退理由、时间、工作补偿等事项。通知可以通过面谈、电话、邮件等方式进行。

4. 履行法定程序：医院清退编外用人需要遵循法定程序，包括听证、申诉等程序，确保清退工作合法、公正、公平。

5. 做好工作补偿：医院需要按照相关政策和协议，给予被清退人员的相应的工作补偿。补偿方式包括提前支付工资、支付社会保险、支付经济补偿等。

总之，医院清退编外用人需要遵循相关政策法规，制定清退方案，通知被清退人员，履行法定程序，并做好工作补偿。清退工作需要严格按照程序进行，确保清退工作的合法性和公正性。