富士康的加班奖金是根据员工的表现和工作量来计算的，不同部门的员工工作内容、难度、时间等各方面条件不同，因此加班奖金也就存在差异。此外，员工的基本工资也不同，更是导致了加班奖金存在差异的原因。通过科学、公正、公平的绩效考核体系，富士康努力实现员工表现与贡献相匹配的奖励，激发员工的工作动力，提高生产力。