不能计入今年预算，民办非企业支付明年预付款应该计入明年的预算，而不是计入今年的预算。

预算是指政府在一定时期内收入和支出的计划，是政府财政政策的重要组成部分。预算的编制必须遵循一定的原则，其中最重要的原则是“实时性”原则，即预算应该反映当前的收入和支出情况，不能将未来的收入和支出计入当前的预算。因此，民办非企业支付明年预付款不能计入今年预算，而应该计入明年的预算。

此外，在预算编制过程中，还应该遵循“全面性”原则，即预算应该全面反映政府的收入和支出情况，不能漏掉任何收入和支出。因此，在编制预算时，应该把民办非企业支付明年预付款纳入预算范围，以确保预算的全面性。