公司不能让员工长期做清洁，因为这不符合职业安全与卫生标准。员工长期从事清洁工作可能会对健康和身体造成不利影响，如长期接触化学物质和灰尘等，容易引起哮喘和皮肤炎等疾病。

另外，长时间的重复机械性劳动也会带来身体负担和疲劳，从而影响工作效率和品质。

公司应该考虑合理分配员工工作任务，遵守劳动保护法和相关规定，保障员工的权益和健康。